如果想要清空 MySQL 数据库中的数据，并让主键从 1 开始自增，可以按照以下步骤进行操作：

1. 连接到 MySQL 数据库，选择要清空数据的数据表。

2. 执行 TRUNCATE TABLE 命令，该命令会将数据表中的所有数据删除，并且会将自增 ID 重置为 1。

TRUNCATE TABLE logs;

注意：使用 TRUNCATE TABLE 命令时，会将数据表中的所有数据删除，无法恢复，请谨慎操作。

3. 如果需要重新调整自增 ID 的起始值为 1，可以执行以下命令：

ALTER TABLE logs AUTO_INCREMENT = 1;

这样就可以清空数据表中的所有数据，并将自增 ID 从 1 开始逐步增加。